基于基因组重测序的公猪精液品质候选基因研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 雷润雨

作者： 雷润雨;阳文攀;冯越;周佳伟;徐忠;李梓芃;吴俊静;乔木;彭先文;梅书棋;张宇

作者机构：

关键词： 精液品质;公猪;精液体积;候选基因

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 81-86

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究基于某企业公猪站172头纯种大白猪10 316条精液品质记录，分别针对精液体积、精液密度、有效精子密度、精子活力、精子畸形率以及直线运动比例进行统计分析，绘制每种性状的分布情况。相关性分析发现，精液体积与精液密度呈负相关，精子活力与直线运动比例呈正相关、与畸形率呈负相关。进一步分别选取精液体积性状极端高和极端低的10个样品，提取基因组DNA，进行15×全基因组重测序，共获得高质量SNPs和InDels 11 400 036个。以10 kb为window、5 kb为步长进行遗传分化系数（Fixation Index,Fst）分析，以0.1%的window为阈值，筛选精液体积高低组的极端分化区域，共获得4.43Mb的区域，包含142个候选基因。利用David工具进行GO富集分析，结果表明候选基因主要参与细胞分裂（GO:0051301）、白细胞运动（GO:1903238）、信号转导（GO:0007165）以及受体聚集（GO:0043113）等生物学过程。其中CDK6、CDK13、CDK14、STAG1和TNKS等基因主要参与细胞分裂过程，且均有与精子质量相关的报道，可作为影响公猪精液品质的候选基因，为后续分子标记的发掘提供理论依据。

分类号： S828.3

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