大白菜功能基因编码区SSRs的分布规律研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周新成

作者： 周新成;李利斌;刘立锋;李化银;高建伟

作者机构：

关键词： SSRs;分布;基因;编码区;大白菜

期刊名称： 天津农业科学

ISSN： 1006-6500

年卷期： 2011 年 17 卷 06 期

页码： 1-5

摘要： 利用数据库中大白菜的部分基因组序列及其注释结果,对大白菜功能基因编码区分布的SSRs类型进行了分析。结果表明,编码区的SSRs以3核苷酸重复的最多,其次为6核苷酸重复的;各种基序的SSRs类型在基因编码区分布的数量有很大差异;另外编码氨基酸的三核苷酸SSRs在11944个基因编码区前100bp、中部及后100bp的分布也有较大差异。说明大白菜基因编码区的SSRs具有相位和极性,其原因在于编码氨基酸的需要。正是这种相位和极性引起大白菜基因编码区SSRs分布的不均一性。

分类号： S634.1

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