玉米KCS家族的全基因组鉴定与胁迫响应分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 皮博艺
作者: 皮博艺;聂治;杜文平;余桂容;甘雨;宋军
作者机构:
关键词: 玉米;β-酮酰辅酶A合成酶;生物信息学;胁迫响应
期刊名称: 西南农业学报
ISSN: 1001-4829
年卷期: 2025 年 38 卷 001 期
页码: 1-11
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】鉴定玉米β-酮酰辅酶A合成酶(KCS)家族基因,并对其进行生物信息学和胁迫应答分析,为玉米的遗传改良提供优异的基因参考。【方法】根据拟南芥KCS家族序列,在玉米基因组中筛选鉴定KCS家族成员,采用生物信息学技术对ZmKCS家族成员进行聚类分析、染色体定位、倍增基因分析、基因与蛋白结构分析,并进一步预测KCS家族基因上游顺式作用元件的类型和数目,结合干旱和盐胁迫下ZmKCS家族的表达水平,鉴定兼具抗旱抗盐的优异基因资源。【结果】在玉米基因组数据库中鉴定出39个ZmKCS蛋白,分布在玉米基因组的9条染色体上,聚类于同一亚族的基因具有相似的基因结构和蛋白结构,进化相对保守,同时在玉米KCS家族中发现基因复制现象,揭示KCS家族基因之间可能存在功能冗余;ZmKCS基因上游存在着大量与干旱胁迫应激相关的顺式作用元件,表明ZmKCS基因可能在干旱胁迫等非生物胁迫中发挥重要功能,ζ亚族中ZmKCS1、ZmKCS7、ZmKCS8和ZmKCS10经PEG和NaCl诱导后上调倍数较高,这几个基因可能更具有耐干旱和盐胁迫的潜力。【结论】玉米KCS家族基因具有抗旱抗盐的潜力,通过生物信息学分析以及PEG和NaCl诱导下的玉米KCS基因的表达模式,鉴定出4个最具潜力的基因资源可用于玉米耐旱耐盐品种的遗传改良。
分类号: S513
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