滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的分子鉴别研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尹利方

作者： 尹利方;陈泽斌;夏体渊;王定康;姚丽媛;华金珠;徐胜光;王家银

作者机构：

关键词： 滇池;沉积物;反硝化细菌;产甲烷菌;分子鉴别

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 154-159

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成。【方法】采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段。【结果】证实了滇池沉积物中存在反硝化细菌和产甲烷菌,且推测产甲烷菌的丰度高于反硝化细菌。2个克隆文库分别获得阳性克隆子55和99个,利用Mothur软件将序列分别划分为10和5个OUT,说明尽管反硝化细菌的丰度低于产甲烷菌,但物种多样性高于产甲烷菌。运用BLASTN程序在GenBank数据库中进行序列比对,发现55个反硝化细菌阳性克隆子可分为10个种类,OTU10类序列与细菌Dechloromonas aromatica的相似性达86%,是反硝化细菌中的优势类群;99个产甲烷菌阳性克隆子可分为5个种类,OTU5类序列与甲酸甲烷规则菌(Methanoregula formicicum)相似性达86%,该类群是反硝化细菌中的优势类群。【结论】滇池沉积物中的反硝化细菌与产甲烷菌多为潜在的未被培养的新种。

分类号： Q93

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