花生茎全长cDNA文库的构建与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈华

作者： 邓烨;张冲;蔡铁城;熊发前;唐荣华;周双彪;庄伟建

作者机构：

关键词： 花生;SMART技术;全长cDNA文库;茎

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2014 年 28 卷 10 期

页码： 1765-1772

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘花生茎中重要的功能基因,了解花生茎生长发育的分子机理,以闽花6号为材料,利用SMART技术成功构建了花生茎不同生育时期混合的全长cDNA文库,并对文库的部分序列进行了测序及分析。结果表明,该文库原始库容为1.25×106cfu·mL-1,重组率达100%,插入片段大小为750~2 000 bp,平均插入片段大小为1 000bp,达到文库质量要求。随机挑选50个单克隆进行5'端测序,共获得50条有效序列。通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因29个,未知功能基因9个,新基因12个,其中47个(94%)基因为花生未报道的基因。因此,该文库的构建为克隆和研究花生茎部重要表达基因,从分子水平上揭示花生茎的生长发育规律提供了基础。

分类号： S565.2`Q943.2

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