甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐磊

作者： 徐磊;胡小文;姚艳丽;邢淑莲;刘洋

作者机构：

关键词： 甜高粱;转录因子;WRKY;RT-PCR

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2017 年 11 期

页码： 2429-2435

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆甜高粱WRKY基因,分析其序列特征和表达谱,为甜高粱抗旱育种提供基因来源。【方法】以甜高粱品种M81-E幼苗总RNA为模板,利用RT-PCR技术克隆甜高粱WRKY基因,通过生物信息学软件分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR检测基因表达情况,获得2条WRKY基因,命名为SbWRKY1(Genebank登录号:KY231904)和SbWRKY2(Genebank登录号:KY231905)。【结果】SbWRKY1 cDNA序列全长1086 bp,包括1个1059 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸。SbWRKY2 cDNA序列全长750 bp,包括1个717 bp的开放阅读框,编码238个氨基酸。2个基因编码的蛋白均具有WRKY核心序列"WRKYGQK"和"C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H"锌指结构模型。SbWRKY1蛋白分子式为C_(1628)H_(2619)N_(509)O_(504)S_(16),预测蛋白质分子量为37.89 kDa,等电点(PI)为9.78。SbWRKY2蛋白分子式为C_(1131)H_(1752)N_(326)O_(344)S_(21),预测蛋白质分子量为26.09 kDa,等电点(PI)为8.43。系统进化树分析表明,SbWRKY1蛋白与高粱、玉米和谷子WRKY蛋白亲缘关系较近,SbWRKY2蛋白与高粱、芒草和玉米WRKY蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,随着干旱胁迫时间延长,SbWRKY1和SbWRKY2呈上调表达趋势。【结论】SbWRKY1和SbWRKY2基因可能在甜高粱应对干旱胁迫中发挥一定作用。

分类号： S566.5

  • 相关文献

[1]WRKY35转录因子的cDNA克隆与植物表达载体的构建. 伍林涛,杜才富,邵明波. 2010

[2]WRKY转录调控因子在植物与病原体互作中的功能. 伍林涛,万谦,韩宏仕,奉斌,康公平,曾章丽. 2014

[3]农作物旱胁迫响应相关转录因子的研究进展. 巩檑,石磊,宋玉霞,陈虞超,甘晓燕,张丽,李苗. 2013

[4]五个WRKY转录因子在水稻叶片生长和抗病反应中的表达研究. 缪刘杨,李莉云,刘钊,刘雨萌. 2013

[5]WRKY转录因子在植物非生物胁迫抗逆育种中的应用. 司爱君,陈红,余渝,孔宪辉,刘丽,王旭文,田琴. 2019

[6]植物WRKY转录因子家族基因研究进展. 卜华虎,王晓清,任志强,肖建红,张宁,杨慧珍. 2020

[7]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

[8]大豆转录因子GmWRKY53的分离及序列分析（英文）. 毕影东,李炜,王萍,刘明,李琬. 2015

[9]葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析. 苏玲,王鹏飞,杨阳,任凤山,王咏梅,陈万钧. 2019

[10]甘薯近缘野生种三浅裂野牵牛WRKY基因家族的生物信息学分析. 杜泰峰,侯夫云,秦桢,王庆美,张立明. 2021

[11]WRKY转录因子功能研究进展. 张娟. 2009

[12]菊芋WRKY转录因子家族基因的鉴定及分析. 赵孟良,郭怡婷,任延靖. 2023

[13]辣椒全基因组WRKY转录因子的分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 2015

[14]高温胁迫下酸枣WRKY转录因子的鉴定及表达分析. 张欢,靳娟,樊丁宇,郝庆,杨磊,牛建新. 2022

[15]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015

[16]蓖麻WRKY14基因的鉴别与信息分析. 黄启星,郭安平,杨礼富,邹智. 2012

[17]Os WRKY80基因参与调控水稻抗病反应研究. 李南羿,柴荣耀,郭泽建. 2009

[18]大豆转录因子GmWRKY57B的基因克隆及功能分析. 张兰,王晓萍,毕影东,张春义,范云六. 2008

[19]植物WRKY转录因子家族基因抗病相关功能的研究进展. 王磊,高晓清,朱苓华,周永力,黎志康. 2011

[20]辣椒WRKY转录因子的鉴别及进化分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序