16S rRNA基因高通量测序方法检测奶牛场常用干草表面微生物群落结构及多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张阁

作者： 张阁;孙翠丽;彭永;程汝佳;杨宏军;朱良全;胡莉萍;丁家波

作者机构：

关键词： 干草;微生物群落及多样性;MiSeq测序

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 2847-2855

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】随着中国奶牛业的发展,干草需求量与日俱增。作为天然牧草,干草可以成为家畜传播病原体的载体。以干草表面附着物为研究对象,了解干草中细菌群落结构以及致病菌属特征。【方法】对来自6个不同奶牛场饲草舍的干草样本,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定干草表面附着物细菌的16S r RNA基因V3-V4变异区序列,分析不同干草样本细菌群落组成。【结果】干草样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为15 416,涵盖了29门87纲144目219科323属的细菌。微生物多样性分析表明,干草样本具有很高的细菌多样性,不同样本多样性存在差异。对干草样本菌群中丰度较高的14种病原菌属进行分析,发现相较于人工种植牧草制备的干草,天然牧草制备的干草中病原菌属丰度较高。【结论】研究解析了干草样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征,对奶牛场疾病防控有一定指导意义。

分类号： S852.6

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