草莓Metacaspase基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑益平

作者： 郑益平;陈坚;朱炳耀

作者机构：

关键词： 草莓;metacaspase;细胞程序性死亡(PCD);基因组;表达分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 35 卷 011 期

页码： 1188-1197

收录情况： CSCD

摘要： [目的]精氨酸/赖氨酸特异性半胱氨酸酶(metacaspases,MCs)在植物生长发育的细胞程序性死亡(programmed cell death,PCD)中发挥重要的调控作用,为系统鉴定草莓FaMC基因家族,进行草莓FaMC基因家族全基因组鉴定及表达分析.[方法]通过草莓全基因组数据分析FaMC蛋白的理化性质、结构域、系统发育关系和保守基序,采用qRT-PCR技术对草莓6个组织器官和6个果实发育时期中的FaMC基因进行表达分析.[结果]蛋白序列分析表明,草莓基因组中21个FaMC成员分为3种类型:I型、I*型和II型.系统发育树和保守结构域分析表明:I型FaMC含N端前结构域且包含1个锌指结构;I*型FaMC含N端前结构域,但其中没有锌指结构;II型FaMC不含N端前结构域.基因表达分析发现,FaMC基因在不同组织中存在表达差异性,I型、I*型和II型FaMC基因分别在叶片、根和花中高表达.在果实发育过程中,多数I*型FaMC基因的表达水平呈现出高-低-高的动态变化趋势;部分I型、II型FaMC在果实发育过程中呈现相反的表达模式.[结论]FaMC基因可能在草莓生长过程中发挥重要作用.

分类号： S668.4

  • 相关文献

[1]海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A_2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析. 杨洪,朱玲,骆晓蕊,周春娅,庄志猛. 2016

[2]油棕WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 周丽霞,曹红星. 2020

[3]‘芙蓉李’糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析. 姜翠翠,方智振,周丹蓉,林炎娟,叶新福. 2022

[4]橡胶树HbMC2在酵母中的表达和抗逆性分析. 刘辉,邓治,杨洪,代龙军,李德军. 2018

[5]草莓FaFIT在拟南芥中异源表达促进根系铁吸收. 陈亚铎,宋艳红,李刚,赵霞,刘丽锋,周厚成. 2022

[6]草莓FaSKP1-1基因的克隆与表达分析. 殷姗姗,李茂福,王华,李洋,张秋雷,金万梅,李天忠. 2016

[7]草莓果实小分子量热激蛋白基因FaHSP17.4的克隆及表达分析. 李刚,赵霞,周路,周厚成. 2016

[8]水杨酸对草莓炭疽病响应基因FaNBS20表达的影响. 张庆雨,刘芳春,段可,王飞,王延秀,高清华. 2014

[9]兔病毒性出血症病毒基因组结构与功能研究进展. 刘光清,云涛,倪征,张玉颖. 2006

[10]西瓜基因组框架图绘制与果实品质基因挖掘. 张海英,林魁,张明方,张建国,张永兵. 2016

[11]CTAB法提取火龙果基因组DNA的试验研究. 韦茜,蔡永强,金吉芬,陶刚,朱英. 2008

[12]利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒. 郑乾明,王壮,彭志军,马玉华,蔡永强. 2017

[13]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015

[14]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[15]国际花生黄曲霉和基因组研讨会将在广东召开. 周桂元. 2006

[16]牛病毒性腹泻-黏膜病核酸疫苗的研究现状. 姜玲玲,周思旋,徐洪忠. 2015

[17]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[18]糙皮侧耳遗传学研究进展. 徐荣荣,图力古尔. 2014

[19]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014

[20]八种植物线粒体基因组结构特征分析与比较. 李玉秋,赵洪锟,谭化,刘晓东,张春宝,董英山. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序