玉米产量因子QTL整合图谱构建与“一致性”QTL确定

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王晓丽

作者: 王晓丽;李新海;王振华

作者机构:

关键词: 玉米;产量因子;数量性状位点(QTL);整合图谱;统合分析

期刊名称: 核农学报

ISSN: 1000-8551

年卷期: 2008 年 22 卷 06 期

页码: 18-23+100

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用生物信息学手段,收集和整理了411个玉米产量及构成因子QTL相关信息,借助高密度玉米遗传图谱IBM2 2005 Neighbors,采用BioMercator2.1软件构建出含221个QTL的整合图谱。采用统合分析方法,在LOD值大于4.0时于玉米第6染色体上确定1个与穗数、粒重和单位籽粒产量相关的"一致性"QTL,由标记bnlg1732和bnl8.08c界定,间距14.51cM。从MaizeGDB网站下载"一致性"QTL区间内基因和标记的原始序列,通过NCBI网站在线软件BLASTx同源比对分析,初步获得3个产量位置候选基因。利用比较基因电子定位策略,将53个水稻和玉米产量相关基因定位到玉米IBM2 2005 Neighbors图谱上,在"一致性"QTL区间内发现1个控制水稻分蘖数基因,初步确定为产量位置候选基因。本文结果为确定有关玉米产量因子的QTL及其候选基因提供了信息。

分类号: S513

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