T3基因型柑橘衰退病毒实时荧光定量RT-PCR检测体系的建立及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶珍珍

作者： 陶珍珍;李中安;贾敏;唐萌;唐科志;周常勇;周彦

作者机构：

关键词： 柑橘衰退病毒;T3基因型;实时荧光定量RT-PCR

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2015 年 42 卷 01 期

页码： 183-190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据不同基因型柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)ORF1a的序列差异,设计T3基因型CTV的特异性引物T3-4F/R,通过优化得到最佳反应条件建立T3基因型CTV分离株的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR,并进行灵敏性、重复性试验。应用该方法测定柑橘植株中T3基因型CTV分离株含量。建立了一种特异性检测T3基因型CTV分离株的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法,其灵敏性比普通RT-PCR方法高100倍。标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,扩增效率为97.1%,相关性系数为0.992。组内和组间变异系数均小于2.94%,表明该方法重复性好。田间样品中T3基因型CTV含量差异较大,最高含量是最低含量的1 250倍。本研究中建立的实时荧光定量RT-PCR检测方法能够准确检测柑橘植株内的T3基因型CTV分离株,可用于研究T3基因型的CTV的变化规律。

分类号： S436.66

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