椰子SPL基因家族的生物信息学及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 钟雅珠

作者： 钟雅珠;马伯军;范海阔;陈析丰;弓淑芳;刘蕊;窦雅静;孙熹微;肖勇

作者机构：

关键词： 椰子;SPL基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 38-45

收录情况： 北大核心

摘要： Squamosa promoter binding protein like（SPL）基因是植物特有的转录因子,在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用。本研究根据已释放的椰子转录组序列信息和水稻SPL基因家族的蛋白序列信息,从椰子转录组中鉴定出24个CnSPL基因,分别命名为CnSPL1～CnSPL24。Pfam分析表明,椰子24个CnSPL基因同样具有拟南芥和水稻中的SBP-box保守结构域。通过聚类分析将24个基因分成6个亚族（G1～G6）。RPKM分析表明,G5亚族的CnSPL1、CnSPL2、CnSPL3和CnSPL4基因在椰子不同组织中均处于高表达水平,而G3亚族中CnSPL5、CnSPL7、CnSPL11和CnSPL13基因在椰子不同组织中则均处于低表达水平。另外,CnSPL家族基因在胚愈伤组织中均有较高表达,说明CnSPL家族很可能参与椰子胚胎愈伤的形成与分化。

分类号： S667.4

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