小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白鹏

作者： 白鹏;程须珍;王丽侠;王素华;陈红霖

作者机构：

关键词： 小豆;SSR标记;遗传多样性;群体结构;连锁不平衡

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 05 期

页码： 788-797

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用57对小豆SSR标记和31对绿豆SSR标记,用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析。结果表明,共检测到630个等位变异,SSR位点等位变异数在2～17之间,遗传多样性指数范围为0.024～0.898,平均为0.574。15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,其中中国云南最高,河北和天津最低。聚类分析将254份材料划分为3个类群,在一定程度上和地理生态环境相关。LD分析显示和其他作物相比,小豆LD衰减距离较短,最大衰减距离为5.8 cM(R2>0.1),基因组LD平均衰减距离小于1 cM(R2>0.1,P<0.001)。

分类号： S521

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