利用EST-SSR标记评价羽扇豆属(Lupinus L.)遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张红岩

作者： 张红岩;杨涛;刘荣;晋芳;张力科;于海天;胡锦国;杨峰;王栋;何玉华;宗绪晓

作者机构：

关键词： EST-SSR;羽扇豆属;转录组;遗传多样性

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2020 年 003 期

页码： 330-340

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用基于窄叶羽扇豆转录组开发并筛选出的95对多态性EST-SSR标记,对羽扇豆属的22个种133份资源进行全基因组扫描,初步探究羽扇豆属下种间的进化关系,分析来源于"旧世界"羽扇豆种间的遗传多样性,为羽扇豆优异资源的挖掘和创新利用提供理论依据.结果表明,用95对SSR标记共检测出1318个等位变异,每对标记平均检测出3~37个等位变异,平均为13.87个;多态性信息量(PIC)变化范围0.39~0.91,平均为0.75;基因多样性变化范围0.41~0.92,平均为0.78.基于邻接法(NJ)的系统发育初步探究了羽扇豆种间的进化关系,22个羽扇豆种分别来源于"旧世界"和"新世界",与之前研究结果相对一致.聚类分析、群体结构分析和主成分分析结果均表明,来源于"旧世界"的7个羽扇豆种被划分为4个组群,各组群所包含的参试资源没有种间交叉重叠.

分类号： S681.9

  • 相关文献

[1]马铃薯转录组EST-SSR挖掘及其多样性分析. 巩檑,程永芳,甘晓燕,陈虞超,聂峰杰. 2015

[2]沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析. 宫文龙,王赞,赵桂琴,马琳,韦宝,龚攀,刘希强. 2019

[3]基于簇毛麦No.1026转录组的SSR序列分析及其PCR标记开发. 陈竟男,马晓兰,王振,李仕金,谢皓,叶兴国,林志珊. 2019

[4]红花EST-SSR分子标记开发与初步验证. 覃瑞,陈贤军,湛蔚,向妮艳,刘虹,严兴初,黄稳,覃尔岱,李刚. 2019

[5]杂交兰转录组SSR信息分析及EST-SSR标记开发应用. 钟淮钦,林榕燕,林兵,吴建设,樊荣辉,叶秀仙. 2020

[6]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020

[7]双须骨舌鱼转录组EST-SSR标记开发与引物筛选. 王且鲁,刘奕,宋红梅,汪学杰,刘超,牟希东,胡隐昌,罗建仁. 2016

[8]辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析. 王运生,田雪亮,茆振川,邹学校,谢丙炎. 2012

[9]胡椒EST-SSR标记的开发和应用. 伍宝朵,郝朝运,范睿,杨建峰,邬华松. 2015

[10]基于转录组测序的油梨EST-SSR引物开发. 应东山,唐浩,韩瑞玺,王文林,王明,王琴飞,汤秀华,张如莲. 2018

[11]猕猴桃果肉颜色性状基因及其EST-SSR标记发掘. 孙淑霞,涂美艳,李靖,陈栋,宋海岩,徐子鸿,廖明安,李明章,江国良. 2025

[12]基于苹果EST-SSR的梨种质资源遗传多样性分析. 路娟,吴俊,张绍铃,吴华清,张妤艳. 2010

[13]基于EST-SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术分析邵武碎铜茶群体遗传多样性与亲缘关系研究. 杨军,孔祥瑞,王让剑,邱丽玲,郑国华,邱陈华. 2019

[14]药用植物苦参EST-SSR标记的开发及DNA指纹图谱的构建. 段永红,雷海英,张旭,吴玉香,孙毅. 2018

[15]拟轮枝镰孢菌EST-SSR信息分析与标记开发. 李新凤,王建明,姜晓东,郝晓娟,张祖维,田宏先. 2018

[16]基于EST-SSR标记的云南大茶树遗传多样性分析. 周萌,李友勇,孙雪梅,王家金,谢瑾,成浩,汪云刚,刘本英. 2013

[17]广西部分地区野生茶树遗传关系EST-SSR标记分析. . 2019

[18]白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选. 剡转转,任艳,吴凡,骆凯,张代玉,闫启,张宇飞,赵玉凤,张吉宇. 2017

[19]基于最适取样策略的老芒麦种质指纹图谱构建及遗传多样性分析. 王惠知,毛丽萍,王雨涵,张宗瑜,郑玉莹,谢文刚. 2021

[20]青花菜DH群体遗传多样性的SSR分析. 孙继峰,刘玉梅,方智远,刘二艳,袁素霞,李占省,杨丽梅,庄木,张扬勇,孙培田. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序