草莓4种主要病毒检测及SVBV贵州分离物基因组测定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王廿

作者： 王廿;贾蒙骜;黄刚;卯婷婷;赵玳琳;陶刚

作者机构：

关键词： 草莓;病毒发生率;核酸序列分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2020 年 003 期

页码： 613-618

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]为了解贵州地区草莓(Fragaria*ananassa)栽培品种中4种主要病毒的发病率和草莓褪绿斑驳病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)贵州分离物与其他分离物的遗传进化关系,对贵州省贵阳市和黔东南州凯里市大棚草莓植株和草莓组培苗进行4种主要草莓病毒检测.[方法]克隆SVBV的全长基因组序列及CP编码的核酸序列后测序并分析.[结果]采集的77份草莓样品检测出SVBV和草莓轻型黄边病毒(Strawberry mild yellow edge virus,SMYEV)2种病毒,未检测到草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)和草莓蚀刻病毒(Strawberry crinkle virus,SCV),其中SVBV的检出率为19.5%,SMYEV为2.6%;SVBV-GZ(GenBank登录号:MH894295)全基因组序列为7859 bp,基因组结构推测有7个开放读框构成,基于SVBV基因组核酸序列的系统发育分析表明SVBV-GZ与SVBV-BJ(GenBank登录号:KR080547)亲缘性较近.[结论]基于SVBV CP氨基酸序列的系统发育分析发现,贵州不同地区草莓SVBV不同分离物与其他中国不同地区分离物同源性较高,可能是由于贵州从全国范围调运草莓种苗造成.

分类号： S436.68

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