务川黑牛TMEM-68基因多态性及其与生长性状的关联性研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 谭尚琴
作者: 谭尚琴;徐龙鑫;陈燕;武俊达;杨丽娟;王鑫;周文章;赵元峰;王华
作者机构:
关键词: 务川黑牛;跨膜蛋白基因;单核苷酸多态性位点;生长性状;lluminaX-10高通量测序平台;分子标记;单倍型
期刊名称: 贵州农业科学
ISSN: 1001-3601
年卷期: 2025 年 53 卷 009 期
页码: 68-75
收录情况: 北大核心
摘要: 【目的】探明务川黑牛跨膜蛋白68基因(TMEM-68)多态性及其与生长性状的关联性,为筛选务川黑牛优势群体和保护牛品种资源提供参考。【方法】以务川黑牛为研究对象,采用PCR和lluminaX-10高通量测序平台对TMEM-68基因进行高通量测序,分析TMEM-68基因与生长性状相关联的单核苷酸多态性(SNP)位点,挖掘优异等位变异位点。【结果】务川黑牛TMEM-68基因存在224(T/A)、360(G/A)、447(T/C)、557(G/T)、938(A/G)、1 135(A/G)、1 319(G/A)、1 567(T/A)8个SNP位点,与其生长性状显著关联。8个SNP多态位点纯合度较高(0.65~0.71),表现为低度多态(PIC<0.25)。224(T/A)位点,TT基因型个体的胸宽和体重显著高于TA型和AA型;360(G/A)位点,AA基因型个体的十字部高、胸围、体高均显著高于GA型;447(T/C)位点,CC基因型个体的体高、十字部高、胸宽显著高于TT型,体高、十字部高显著高于TC型;557(G/T)位点,GT和TT基因型个体的体斜长显著高于GG型;938(A/G)位点,GG和AA基因型的个体胸宽显著高于AG型;1 135(A/G)位点,AA和GG基因型个体的坐骨端宽显著高于AG型;1 319(G/A)位点,GA和AA基因型个体的十字部高显著高于GG型;1 567(T/A)位点,TT和TA基因型个体的胸宽显著高于AA型。单倍型分析发现,务川黑牛群体中存在7种单倍型,其中,H1单倍型个体数目明显多于其他单倍型组合,为优势单倍型;单倍型组合分析结果表明,H2H6单倍型组合的十字部高、体斜长、管围、坐骨端宽具有较大优势,H1H7单倍型组合的个体胸宽、体高、体重具有优势。【结论】TMEM-68基因与务川黑牛生长性状密切相关,可作为务川黑牛品种资源开发与选育的候选分子标记。
分类号: S823
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