大蒜全基因组ABCB基因鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李梦倩

作者： 李梦倩;樊继德;葛洁;杨青青;陆新娟;赵永强;刘灿玉;张碧薇;刘光杨;杨艳;杨峰

作者机构：

关键词： 大蒜;ABCB基因家族;体细胞胚

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 40 卷 012 期

页码： 2207-2218

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究生长素转运蛋白ABCB基因(AsaABCB)在大蒜体细胞胚发生过程中的作用机理，以徐蒜6号为试验材料，采取生物信息学方法，对大蒜AsaABCB基因家族成员进行全基因组鉴定，并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行胚发育过程中AsaABCB家族基因表达模式分析。结果表明，大蒜中共存在17个AsaABCB基因，定位在7条染色体上，在系统进化树上可分为5个亚组。AsaABCB基因编码的氨基酸数量为545～1 379个，相对分子量为59 627.17～152 864.21,理论等电点为5.72～9.34。AsaABCB4、AsaABCB6、AsaABCB15蛋白定位于细胞膜和细胞质中，其余AsaABCB蛋白仅定位于细胞膜。17个AsaABCB基因的启动子区存在196个光反应元件、48个茉莉酸反应调控元件、26个脱落酸反应元件及12个生长素响应元件。11个AsaABCB家族基因在大蒜胚性愈伤组织(EC)阶段相对表达量较高，5个AsaABCB家族基因在愈伤组织(CA)阶段表达量较高，这表明该家族基因可能主要调控大蒜体细胞胚发育过程中EC和CA的形成与发育。本研究结果为深入探索大蒜体细胞胚发育过程中AsaABCB基因的功能奠定基础。

分类号： S633.4

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