猪戊型肝炎病毒黑龙江分离株SWHLJ-BXBX全基因组序列的测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李海

作者： 李海;王刚;张交儿;何希君;刘永刚;姜成刚;王淑杰;涂亚斌;蔡雪辉

作者机构：

关键词： 猪戊型肝炎病毒(HEV);Ⅳd基因亚型;序列分析;全基因组测序;序列特征;进化树

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2017 年 11 期

页码： 176-178

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究猪戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)黑龙江分离株SWHLJ-BXBX的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析,试验采用RT-n PCR、5'-RACE、3'-RACE方法和Megalign、MEGA 6等生物学软件对SWHLJ-BXBX的全基因组序列进行了研究。结果表明:SWHLJ-BXBX全基因组序列去除poly A后全长为7 240 bp,5'UTR有25个碱基,3'UTR全长为70 bp,ORF1编码1 707个氨基酸,ORF2编码674个氨基酸,ORF3编码114个氨基酸,进化树分析表明SWHLJBXBX属于HEVⅣd基因亚型。

分类号： S852.651

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