辣椒属种资资源ITS序列与系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刁卫平

作者： 刁卫平;王述彬;刘金兵;潘宝贵;戈伟

作者机构：

关键词： 辣椒属;ITS;系统发育;亲缘关系

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 11 卷 06 期

页码： 141-149

收录情况： CSCD

摘要： 分析辣椒属ITS序列,为辣椒属系统位置、进化关系提供分子生物学依据。以辣椒属(Capsicum)4个栽培种36份不同基因型辣椒种质资源为试材,对其rDNA转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)进行PCR扩增。扩增产物经纯化、克隆和测序后,获得ITS序列信息,随后利用MEGA 5.05软件分析其序列特征,并探讨了辣椒属种质资源的系统进化关系。结果表明,辣椒属ITS基本序列全长656 bp,G+C含量57.47%。供试材料的ITS序列长度变异较大,ITS1、5.8S和ITS2区长度变异都有发生。序列比对表明,供试辣椒材料ITS区共有387个变异位点(ITS1:153;5.8S:82;ITS2:152),信息位点322个,同源性为71.0%~100%,遗传分歧为0~0.3604。以烟草为外类群,将ITS1、5.8S和ITS2序列作为一个共同的数据矩阵进行系统发育树构建,辣椒属C.frutescens和C.baccatum种被单独分出,C.chinense和C.annuum种聚在一起,C.annuum与其他3个栽培种的亲缘关系由近至远分别是C.chinense、C.frutescens和C.baccatum,C.annuum种的32份供试材料主要分为3个分支6个亚分支,聚类分析结果与形态分类不能完全对应。

分类号： S641.3

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