云南省水稻矮缩病毒S10片段的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张磊

作者： 张磊;董家红;朱勇;张仲凯

作者机构：

关键词： 水稻矮缩病毒;S10片段;同源性分析

期刊名称： 昆明学院学报

ISSN： 1674-5639

年卷期： 2010 年 06 期

页码： 93-94+97

摘要： 用RT?PCR方法从云南省寻甸、嵩明、通海、芒市、沾益和陆良6个地区的水稻样品中扩增到水稻矮缩病毒S10片段部分序列,核苷酸测定及序列分析表明,6个地区水稻矮缩病毒分离物S10片段部分序列长度均为1 071个核苷酸,含1个1 059个核苷酸的ORF,编码352个氨基酸.云南分离物S10片段之间的核苷酸同源性约为97.9%~99.9%,其编码的氨基酸同源性为97.7%~100%;云南分离物与日本分离物的S10片段核苷酸同源性和氨基酸相似性分别为94.1%~95.4%和96.3%~99.2%,与中国分离物的S10片段核苷酸同源性和氨基酸相似性分别为94.8%~96.6%和95.2%~96.6%.云南分离物在亲缘关系上与日本分离物较中国分离物近.

分类号： S435.111.4

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