结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄春琼
作者: 黄春琼;何潇;罗丽娟;董荣书;刘国道
作者机构:
关键词: 结缕草属;EST-SSR;分子标记;遗传多样性;群体结构
期刊名称: 草地学报
ISSN: 1007-0435
年卷期: 2024 年 32 卷 008 期
页码: 2386-2393
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料,利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat, EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明:从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引物;共检测到124个标记,平均每对引物检测到4个,多态性标记有108个,多态性位点百分率为88.60%;种质间遗传相似性系数为0.530~0.864,平均为0.711;共检测到104个观察等位基因,平均每对引物检测到3个;有效等位基因数范围为0~5,平均为3;Shannon信息指数变化范围为0~1.593,平均为0.940。Nei’s基因多样性指数范围为0~0.793,平均为0.541;在遗传相似性系数为0.800时,利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)法将43份种质划分为4个类群,聚类结果与种质地理位置有一定的关联,但联系不紧密。本研究结果表明43份种质的遗传多样性处于上等水平,EST-SSR标记能有效地评价结缕草属种质的遗传差异,为结缕草属种质资源的鉴定评价及分子标记辅助育种提供参考依据。
分类号: S688.4
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