结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄春琼
作者: 黄春琼;何潇;罗丽娟;董荣书;刘国道
作者机构:
关键词: 结缕草属;EST-SSR;分子标记;遗传多样性;群体结构
期刊名称: 草地学报
ISSN: 1007-0435
年卷期: 2024 年 32 卷 008 期
页码: 2386-2393
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料,利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat, EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明:从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引物;共检测到124个标记,平均每对引物检测到4个,多态性标记有108个,多态性位点百分率为88.60%;种质间遗传相似性系数为0.530~0.864,平均为0.711;共检测到104个观察等位基因,平均每对引物检测到3个;有效等位基因数范围为0~5,平均为3;Shannon信息指数变化范围为0~1.593,平均为0.940。Nei’s基因多样性指数范围为0~0.793,平均为0.541;在遗传相似性系数为0.800时,利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)法将43份种质划分为4个类群,聚类结果与种质地理位置有一定的关联,但联系不紧密。本研究结果表明43份种质的遗传多样性处于上等水平,EST-SSR标记能有效地评价结缕草属种质的遗传差异,为结缕草属种质资源的鉴定评价及分子标记辅助育种提供参考依据。
分类号: S688.4
- 相关文献
[1]与甘蓝中心柱长相关联的EST-SSR标记分析. 孙朋朋,刘基生,张扬勇,方智远,刘玉梅,杨丽梅,龚义勤,柳李旺,李占省. 2014
[2]川、渝地方茶树品种的遗传多样性和群体结构. 姚明哲,马春雷,金基强,马建强,陈亮. 2012
[3]与甘蓝中心柱长相关联的 EST-SSR 标记分析. 孙朋朋,刘基生,张扬勇,方智远,刘玉梅,杨丽梅,龚义勤,柳李旺,李占省,庄木. 2014
[4]基于EST-SSR的64个茶树品种遗传多样性与群体结构分析. 杨军,王让剑,孔祥瑞,郑国华,苏峰. 2018
[5]辣椒EST-SSRs的分布特征及在品种多样性研究中的应用. 魏兵强,刘飞云,马宗桓,陈灵芝,张茹. 2013
[6]海滨雀稗EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发. 李华勇,王显生,王艳平,吴燕,沈奇,贾新平. 2016
[7]4个茶树品种自交后代群体遗传结构分析. 杨军,王让剑,孔祥瑞,郑国华. 2016
[8]EST-SSR标记与茶树表型性状关联的初步分析. 姚明哲,乔婷婷,马春雷,金基强,陈亮. 2010
[9]藜麦EST-SSR的开发及通用性分析. 张体付,戚维聪,顾闽峰,张晓林,李坦,赵涵. 2016
[10]麦红吸浆虫唾腺EST-SSRs的信息分析及分子标记筛选. 吴仁海,罗礼智,武予清,蒋月丽,苗进,巩中军. 2011
[11]轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用. 刘新星,石有太,罗俊杰,欧巧明,陈子萱,李忠旺. 2018
[12]植物EST-SSR研究进展. 陈思,吴广文,吴建忠,黄文功,刘岩,杨学. 2018
[13]丝瓜(Luffa cylindrica)EST-SSR分子标记的验证及多态性分析. 骆彩霞,罗剑宁,赵钢军,何晓莉,周玲艳,吴海滨. 2020
[14]西瓜EST-SSR分子标记的筛选. 邹明学,陈艳红,徐勇,郭绍贵,张海英,宫国义. 2009
[15]基于EST-SSR标记的西双版纳苦茶资源遗传多样性分析. 尚卫琼,李友勇,刘悦,段志芬,杨盛美,李慧,许燕,刘本英. 2020
[16]山羊EST资源的SSR分析. 赵传志,李爱芹,李长生,刘波,夏晗,王兴军,贾文斌. 2009
[17]植物功能基因组研究中的几种新型分子标记. 张伟峰,于拴仓,郝浩永,陈莉. 2010
[18]花椰菜EST-SSR反应体系的优化. 林珲,朱海生,陈敏氡,王彬,温庆放,吴卫东. 2015
[19]基于EST-SSR标记的云南大叶茶资源遗传多样性分析. 尚卫琼,段志芬,杨毅坚,李友勇,成浩,刘杰,杨兴荣,杨盛美,矣兵,刘本英,毕晓清. 2018
[20]基于表达序列标签的微卫星标记(EST-SSRs)研究进展. 李永强,李宏伟,高丽锋,何蓓如. 2004
作者其他论文 更多>>
-
荔枝园间作柱花草对土壤理化性质和土壤细菌群落结构的影响
作者:李承臻;袁秉琛;王燕茹;蓝俊;罗丽娟;虞道耿
关键词:荔枝;间作;柱花草;土壤养分;土壤细菌群落结构
-
柱花草SgALMT1基因克隆与表达分析
作者:缪野;刘怀锦;刘莉婷;罗丽娟;陈志坚
关键词:柱花草;铝毒害;基因表达;苹果酸;亚细胞定位
-
结缕草属种质资源形态特征变异
作者:何潇;段宏利;罗丽娟;黄春琼
关键词:结缕草;种质资源;形态特征;变异
-
16种山蚂蝗属种质资源营养价值评价
作者:杨孝奎;黄冬芬;胡安;郇恒福;郇树乾;刘国道;刘许霖
关键词:山蚂蝗;营养价值;单宁含量;综合评价;种质资源;南方草牧业
-
‘桂南’狗牙根的选育
作者:黄春琼;刘国道;罗丽娟;王文强;杨虎彪
关键词:狗牙根;新品种;形态及生物学特性;品比试验;区域试验;生产性试验;栽培技术
-
柱花草根系分泌物对缺磷胁迫的响应分析
作者:赵仓;吴远航;赵兴坤;孙昊;杨丽云;刘攀道;罗丽娟
关键词:柱花草;缺磷胁迫;根系分泌物;代谢组学;有机酸
-
我国热带作物种质资源收集保存与创新利用
作者:滕建国;王家保;徐立;李琼;刘国道
关键词:热带作物;种质资源;收集;保存;创新;利用