43种植物CaM1基因密码子使用特征及遗传差异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晨辉

作者： 李晨辉;赵子捷;陈文烨;焦义然;杨帆;刘永伟;董福双;杜进民;周硕

作者机构：

关键词： CaM1;密码子偏性;遗传距离;亲缘关系

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2019 年 05 期

页码： 28-32

摘要： 为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1,简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异。运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析,并构建系统发育树。结果表明,CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性,CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子,禾本目植物更偏好使用G/C碱基。G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因。遗传距离分析表明,山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近,豆目和无患子目间的亲缘关系次之,与聚类分析结果相符。

分类号： Q943

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