利用PCR产物混池重测序检测梨褐皮关联SLAF标签多态性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒋爽

作者： 蒋爽;王晓庆;施春晖;李水根;骆军

作者机构：

关键词： 梨;SLAF标签;SNP;多态性;重测序

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 51 卷 004 期

页码： 707-714

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 在己知梨褐皮关联的SLAF标签(Marker286117)序列上存在4个SNP位点,共有4个基因型(a~d)的基础上,使用PCR加混池重测序技术鉴定该SLAF标签在64个梨品种中的多态性.共获得7.1 Gb原始数据,通过编译的SNP-rseq和Calculate程序对数据进行处理,64个梨样品获得的平均read数量为117 642条,满足分析需求.在该SLAF标签上新发现2个基因型(e和f).6个基因型中c为原始类型,在栽培种砂梨和白梨中鉴定到b、d和e基因型;a和f基因型则出现在拥有西方梨血统的样品中.对基因型和表型统计后发现,c基因型存在时,梨果皮为褐色,不含c基因型时为绿色.该规律不仅适用于东方梨,在西方梨的一些样品中也适用.混池重测序技术降低了测序成本,相关技术手段能够应用于简化重测序后续的验证和标记辅助育种.

分类号： S661.2

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