草鱼种群SSR分析中样本量及标记数量对遗传多度的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李鸥

作者： 李鸥;赵莹莹;郭娜;鲁翠云;孙效文

作者机构：

关键词： 样本容量;标记量;草鱼;自然群体;遗传多样性;微卫星分子标记

期刊名称： 动物学研究

ISSN： 0254-5853

年卷期： 2009 年 30 卷 02 期

页码： 121-130

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用45对微卫星分子标记(SSR),以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)自然群体为实验材料,探讨野生群体遗传多样性研究中所需的最适样本量与标记量。实验设置6个样本量梯度,9个标记量梯度。对等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等遗传多样性指标的变化趋势进行统计分析。结果表明,样本量、微卫星标记的数量和多态性水平对群体遗传多样性均有较大的影响,其中等位基因数与样本量大小呈显著正相关,而杂合度随标记量的增多而剧烈波动。当取样量大于40,标记量大于25时,各遗传参数值趋于稳定。因此,在应用微卫星标记对水产动物自然群体的遗传学研究中,要根据所研究种类的特点,尽可能采样40尾以上,采用25个以上标记,避免由人为选择的偏差对群体遗传多样性水平的正确评估所造成的影响。同时根据上述研究结果,对陕西草鱼自然群体进行了遗传多样性的评估,结果显示该群体平均等位基因数(MNA)、平均有效等位基因数、平均观测杂合度、平均期望杂合度分别为7.26、4.21、0.73、0.68,认为该群体具有较高的遗传多样性。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]磁珠富集法分离草鱼微卫星分子标记. 孙效文,鲁翠云,梁利群. 2005

[2]3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性分析. 林明辉,朱华平,苏换换,樊佳佳,池金泉,马冬梅. 2021

[3]中国冬、春性小麦品种遗传多样性的微卫星标记分析. 杨慧勇,林凡云,陆琼娴,徐剑宏,史建荣. 2007

[4]扁吻鱼微卫星的筛选及群体多样性分析. 郝卓然,梁利群,常玉梅,唐然,李世国,任波. 2012

[5]基于简化基因组测序宽鳍鱲的微卫星分子标记及遗传多样性分析. 覃宁,张桂蓉,马徐发,魏开建. 2024

[6]基于微卫星分子标记的中国瓜实蝇不同地理种群遗传分化分析. 张亚楠,牛黎明,周世豪,龚治,李磊,张方平,韩冬银,符悦冠. 2018

[7]长江中游水系鲢和草鱼群体mtDNA遗传变异的研究. 张四明,汪登强,邓怀,余来宁. 2002

[8]安徽省草鱼养殖群体遗传多样性及遗传结构分析. 汪焕,江河,段国庆,周华兴,胡玉婷,凌俊,潘庭双,陈小雷. 2020

[9]草鱼EST-SSR标记及5个不同地域群体的遗传结构分析. 王解香,于凌云,白俊杰,樊佳佳,全迎春. 2011

[10]草鱼遗传结构和遗传多样性的研究概况. 曹婷婷,白俊杰,王解香,于凌云. 2012

[11]长江水系鲢和草鱼遗传结构及变异性的RAPD研究. 张四明,邓怀,汪登强,余来宁. 2001

[12]基于26个微卫星标记的三江水系草鱼遗传多样性分析. 周盼,张研,徐鹏,鲁翠云,孙效文. 2011

[13]长江水系钱草鱼遗传结构及变异性的RAPD研究. 张四明,邓怀. 2001

[14]基于微卫星评估草鱼放流亲本对野生群体遗传多样性的影响. 季晓芬,段辛斌,刘绍平,陈大庆,汪登强. 2018

[15]草鱼EST-SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析. 王解香,白俊杰,于凌云. 2012

[16]鄱阳湖水系草鱼野生及增殖放流群体遗传多样性分析. 张燕萍,陈文静,汪登强,段辛斌,徐先栋,王昌来. 2013

[17]空间抽样方法估算冬小麦播种面积. 王迪,周清波,陈仲新,刘佳,邓辉. 2012

[18]牛奶中脂肪酸相关性及其样本容量的确定. 杨晋辉,周凌云,卜登攀,杨永新,袁廷杰,张军民. 2012

[19]棉花品种区域试验适宜试验点数量的抽样估计. 许乃银,金石桥. 2013

[20]暴露评估中样本采集量的模拟研究. 宋雯,陈志军,王敏,钱永忠,徐辰武. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序