基于小RNA测序技术和RT-PCR检测云南省大樱桃病毒

文献类型: 中文期刊

第一作者: 郭淼

作者: 郭淼;李婷婷;王朝文;钟静;陈越;和加卫;丁铭

作者机构:

关键词: 云南;大樱桃;小RNA深度测序;病毒种类

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2023 年 53 卷 005 期

页码: 950-958

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 我国是大樱桃的主要产区,目前种植面积位居世界首位,随着种植面积的不断扩大,病毒病严重制约了大樱桃生产.本研究对云南3个大樱桃主要繁育基地(陆良、宣威和丽江)的6个大樱桃品种的病毒病发生情况调查,发现主要症状为植株矮化、小叶、叶片皱缩、畸形、斑驳、叶片褐色斑点等症状,发病率在10%~30%之间.对每个品种混合样品进行小RNA测序,并利用RT-PCR对小RNA测序分析得到的病毒种类进行验证.结果表明,在陆良样品中检测到樱桃病毒A(cherry vi-rus A,CVA)、李属坏死环斑病毒(prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)、李树皮坏死与茎痘伴随病毒(plum bark necrosis stem pitting-associated virus,PBNSPaV)、柑橘叶斑病毒(citrus leaf blotch virus,CLBV)和樱桃小果病毒-1(little cherry virus-1,LChV-1);宣威样品中检测到CVA和PNRSV;丽江样品中检测到CVA、PNRSV、PBNSPaV、CLBV和樱桃小果病毒-2(lit-tle cherry virus-2,LChV-2).序列分析表明,这5种病毒分别与GenBank中登录注册的病毒核苷酸序列均具有较高的一致性.其中,PNRSV在不同种植区的品种中检出率较高,推测有可能是目前云南大樱桃种植区的主要病毒种类,其危害情况有待于进一步研究.

分类号: S436.629

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