小麦和水稻auxin基因家族的生物信息学比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张俊红

作者： 张俊红;孟成生;张彩英;史峥;王笑颖;李爱丽;马峙英

作者机构：

关键词： 小麦;水稻;植物生长素

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2009 年 24 卷 06 期

页码： 15-19

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据测序获得的1条260 bp cDNA片段,通过预测发现其包含小麦植物生长素(AUXIN)基因的部分编码序列,通过电子延伸、设计引物,从小麦Mardler/7*百农3217的cDNA中扩增获得一条608 bp的cDNA片段,该基因序列数据库(GenBank)登录号为AY902381(基因)和(蛋白)。编码202个氨基酸,预计蛋白的分子量为23.0 kDa,等电点为9.93。利用已经分离的小麦生长素(AUXIN)基因的保守序列为检索序列,对小麦和水稻中的AUXIN基因家族成员进行分析,利用这些基因编码蛋白序列构建系统发生树,查找在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列,分析了这些基因在细胞中的定位情况和蛋白结构的相似性,根据已知相似基因的功能,分析该基因有进一步深入研究的必要。

分类号： S512.1`S511

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