海南仙人掌matK基因的克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴育鹏

作者： 吴育鹏;余乃通;周启林;王健华;刘志昕

作者机构：

关键词： 仙人掌;matK基因;克隆;序列分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2016 年 35 卷 11 期

页码： 3135-3140

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2015年12月,为了分析采自海南海口城西仙人掌mat K基因的序列及同源关系,利用RNA plant Reagent试剂盒提取仙人掌叶总RNA,反转录成第一链c DNA。同时设计仙人掌成熟酶K基因(mat K)的1对保守引物,利用RT-PCR的方法扩增仙人掌成熟酶K基因,所得序列经Blastn进行比对,发现与已报道的22个仙人掌mat K基因核苷酸序列一致;利用Blastn的Distance tree of results构建系统进化树,结果显示海南仙人掌mat K基因与其它报道的30个仙人掌mat K基因同源性最高,同源性在99%以上,属于同一组,而与Opuntia basilaris(Gen Bank accession No.JF786750.1)同源性最低,为96.6%。本研究利用RT-PCR方法获得了仙人掌成熟酶K基因序列,同时构建的系统进化树确定了该仙人掌成熟酶K基因的同源关系。本结果将为海南仙人掌的进化研究提供科学线索。

分类号： S682.33`Q943.2

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