七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 齐晓阳

作者: 任小云;安涛;陈红印;黄建;张礼生

作者机构:

关键词: 七星瓢虫;滞育;转录组测序;滞育关联基因;KEGG分析、碳水化合物代谢

期刊名称: 环境昆虫学报

ISSN: 1674-0858

年卷期: 2016 年 38 卷 02 期

页码: 238-248

收录情况: 北大核心

摘要: 对七星瓢虫正常发育、滞育以及滞育解除的雌成虫进行RNA测序,并对筛选出来的滞育相关基因进行KEGG通路富集分析,从分子水平解析七星瓢虫滞育发机理。本研究以正常发育产卵、滞育30 d以及滞育贮存30 d后解除产卵的七星瓢虫雌成虫为研究对象,分别抽提RNA,合成c DNA,构建c DNA文库,文库检测合格后在Illummina Hiseq 2500测序仪上进行双向测序。根据测序结果,共获取unigene 82820个。采用两两比较法对正常发育组和滞育组、滞育组和滞育解除组进行差异表达分析,分别获得差异表达基因3501个和1427个。深入分析两组比对结果,将在滞育组上调且滞育解除组下调的unigene定义为滞育关联基因,共有443个基因为滞育关联基因。应用KEGG KAAS在线pathway比对分析工具对滞育关联基因进行通路富集分析,结果发现这些基因主要集中在碳水化合物代谢、脂质代谢以及信号转导等途径中。

分类号: S476.2

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