新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 代培红

作者： 代培红;郭龙;李月;姚正培;罗淑萍

作者机构：

关键词： 野扁桃;转录因子;CBF基因;抗寒

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 14 卷 01 期

页码： 71-76

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以野扁桃为实验材料,提取叶片的RNA,设计基因特异性引物,利用RT-PCR克隆转录因子CBF的c DNA全长,命名为Als CBF1-A(登录号KU975456);并对其基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该转录因子基因的CDS区长699 bp,编码232个氨基酸,编码蛋白相对分子质量约为26.027 2 k D,p I 4.84;由无规则卷曲(C),α-螺旋(H),β-折叠(E)组成,分别占52.17%,21.74%和26.09%;有较强的亲水性,无跨膜区和信号肽存在,有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点;同源性分析表明Als CBF1-A基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关,此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。

分类号： S662.9`Q943.2

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