云南水稻条纹病毒RNA3的分子变异及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龙亚芹

作者： 龙亚芹;王万东;李凡;杨文娟;陈海如

作者机构：

关键词： 水稻条纹病毒;RNA3;分子变异;遗传多样性

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2011 年 24 卷 02 期

页码： 570-574

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为从分子水平上探讨云南水稻条纹病毒(RSV)分子变异及其遗传多样性,采用RT-PCR技术,对云南省大理州巍山县和昆明市宜良县2个分离物的RNA3进行克隆和测序,获得RNA3YWS和RNA3YYL全长序列,2个分离物的RNA3核苷酸序列长度分别为2489和2490 bp。并将获得的序列与不同时期、不同区域的RNA3全长序列进行比较,并对22条RNA3序列构建系统发育树。结果表明,YWS和YYL与YBS、YA、FYi等分离物具有更近的亲缘关系,与云南以外的中国分离物和日本T和M分离物亲缘关系较远,表明RSV在自然界中的分子变异与地理分布有着密切的关系。根据不同基因在核苷酸和氨基酸水平上的差异,探讨了22条RNA3的分组情况,YWS和YYL同属于第一组,即云南组;同时对RNA3 2个编码基因及IR3在DNA水平上的遗传多样性进行分析,综合分析了云南RSV不同分离物RNA3的分子变异。推测云南独特的地理气候条件和丰富的生物多样性可能是造成云南RSV复杂遗传分化的主要原因。

分类号： S435.111.4

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