枸杞自交不亲和基因S-RNase密码子偏性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 段淋渊

作者： 段淋渊;戴国礼;焦恩宁;秦垦

作者机构：

关键词： 枸杞;密码子;偏好性;S-RNase;聚类分析

期刊名称： 西南林业大学学报(自然科学)

ISSN： 2095-1914

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 44-52

收录情况： 北大核心

摘要： 为了掌握枸杞S-RNase密码子及其使用偏好性,利用EMBOSS和Codon W软件分析了枸杞S-RNase基因密码子的使用偏好性,并将其与酵母、大肠杆菌和柑橘等10种植物S-RNase基因密码子偏好性进行比对,结果表明:枸杞S-RNase密码子偏好以A/T结尾;RSCU值显示该基因高频率使用的密码子有9个,相较其他物种同源基因存在明显的密码子偏好性差异。此外,较密码子使用偏好性分析结果,基于S-RNase基因编码序列的聚类结果更能准确地反应物种之间的亲疏关系。比对其他物种该基因密码子的使用频率发现,同科物种差异较小,不同科物种差异较大;同时对比使用频率发现,枸杞S-RNase基因更适合导入酵母菌进行异源表达,但需要对其进行适当优化改造。

分类号： S567.19

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