运用二元阈值法识别日本血吸虫DNA序列的编码区
文献类型: 中文期刊
第一作者: 隋传宇
作者: 隋传宇;冯新港
作者机构:
关键词: 日本血吸虫;序列谱;FFT;FTG;Z曲线;编码区识别
期刊名称: 上海师范大学学报(自然科学版)
ISSN: 1000-5137
年卷期: 2006 年 02 期
页码: 89-94
摘要: 分析了日本血吸虫DNA序列的编码区特征,发现其能够很好地满足1/3规则.研究表明,无论采用FTG还是序列谱(FFT)的方法,对于长度较短的序列都不适用.该研究首次使用二元阈值(p,R)方法判别编码区,其判别能力优于一元(p)阈值.统计试验结果为:单独使用z曲线方法,总的准确率为55.3%.联合使用Z曲线和FTG方法,对大于951bp的序列编码区预测准确率可达到78.2%.
分类号: Q811.4
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