北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选
文献类型: 中文期刊
第一作者: 白云华
作者: 白云华;王立贤;陈华林;麻柱;杨超;路永强;王楚端;黄全奎;邢凯;王朝军;薛振华
作者机构:
关键词: 北京黑猪;杜洛克猪;背最长肌;肌内脂肪;转录组
期刊名称: 中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2024 年 60 卷 009 期
页码: 118-124
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究旨在鉴定北京黑猪与杜洛克猪背最长肌(LDM)组织中的差异表达基因(DEGs),筛选影响猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)沉积的关键基因及通路。研究选取北京黑猪和杜洛克猪各6头,采集其背最长肌组织,提取RNA并进行转录组测序。将测序数据进行比对、定量后,利用DESeq2筛选差异表达基因(|log2FC|≥1,P<0.05)并进行GO分析和KEGG分析。结果表明:2个品种猪背最长肌组织中共检测到206个差异表达基因,其中,100个基因在北京黑猪肌肉组织中高表达,106个基因在杜洛克猪肌肉组织中高表达。差异表达基因显著富集在24条通路,其中AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂质和动脉粥样硬化和脂肪酸代谢等通路参与了脂肪生成和代谢的过程。经进一步分析,ELOVL6、FASN、SCD、SQLE和NR4A1等基因在肌内脂肪生成的过程中发挥关键作用。该研究结果为猪肌内脂肪沉积的分子调控机制提供了参考。
分类号: S828.2
- 相关文献
[1]槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释. 杨建敏,胡宇平,林威敏,张金耀,黄守婷,叶鼎承,肖天放. 2016
[2]利用超声波图像活体预测北京黑猪肌内脂肪含量. 马小军,程笃学,王立刚,刘欣,宋欣,梁晶,张龙超,颜华,王立贤,陈来华,谢蜀杨. 2012
[3]三个猪种肌肉脂肪酸含量分析. 于永生,张志彬,罗晓彤,李兆华,朴庆林. 2016
[4]猪生长肥育期背最长肌LPL基因表达与肌内脂肪含量相关研究. 廉红霞,卢德勋,高民. 2007
[5]高低肌内脂肪猪背最长肌关键基因表达差异分析. 谭娅,李亮,雷宇航,黄志洋,赵春萍,张静,张正群,齐婧,朱砺,史开志. 2022
[6]基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因. 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广. 2018
[7]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019
[8]基于转录组分析挖掘平凉红牛背最长肌肉质性状候选基因. 王文翔,杜丽丽,胡俊伟,张琰翔,马铭昊,段蕊,钱聪,王欣玥,李三禄,张长庆,张路培,高雪,徐凌洋,李俊雅,高会江. 2023
[9]四川麻兔背最长肌DNA甲基化和转录组联合分析. 李钰莹,邝良德,郑洁,李丛艳,郭志强,雷岷,谢晓红. 2024
[10]野猪与北京黑猪杂交试验. 何鑫淼,王文涛,吴赛辉,彭福刚,汪博,刘娣. 2011
[11]干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段肠道消化物菌群组成及乳酸、短链脂肪酸和长链脂肪酸含量的影响. 王四新,季海峰,王红卫,刘辉,石国华,张董燕,王晶,张伟,王雅民. 2020
[12]杜仲粉对松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪免疫功能的影响. 王浩,赵少伟,张爽,柴方红,张树敏,王大林,贾立军. 2020
[13]松辽黑猪与北京黑猪杂交后代MyoD1基因的SNP位点分析. 王浩,赵少伟,谢素珠,张树敏,王大林,贾立军. 2020
[14]北京黑猪MYH3和MYH13基因多态性与肉质性状的关联分析. 杨曼,刘海,张润,胡紫平,牛乃琪,王立贤,张龙超. 2022
[15]北京黑猪FSHβ亚基基因的多态性与繁殖性状的关联分析. 罗仍卓么,王立贤,孙世铎. 2007
[16]北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析. 祝雪丽,张龙超,王立贤,蒲蕾,刘欣. 2024
[17]北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析. 牛乃琪,苏艳芳,杨曼,侯欣华,王立刚,张龙超. 2023
[18]北京黑猪FUBP3和USP43基因多态性与眼肌面积性状的关联分析. 侯任达,张润,牛乃琪,杨曼,黄晓宇,李慧慧,张龙超. 2022
[19]北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析. 苏艳芳,牛乃琪,宗文成,刘先策,刘海,石国华,井西涛,张龙超. 2024
[20]棉籽饼;猪的良好蛋白质饲料. 高振川,张玉发,金月英,姜云侠,刘金旭. 1982
作者其他论文 更多>>
-
奶牛妊娠诊断-传统与自动化技术研究进展
作者:汪超;沙里金;庞云渭;原开敏;修豪宇;杨书含;路永强;王栋
关键词:早期妊娠诊断;自动化;体温;活动量
-
氨基酸平衡低蛋白日粮对5~6月龄犊牛生长性能和瘤胃发酵参数的影响
作者:王俊;成述儒;杨春涛;屠焰;路永强;杨宇泽;付瑶
关键词:低蛋白日粮;氨基酸平衡;生长性能;瘤胃发酵参数;犊牛
-
民猪猪繁殖与呼吸综合征恢复力高低组血清代谢组学研究
作者:孟祥旭;李佳;任德明;陈奎蓉;和艺云;王立贤;盛熙晖;王立刚
关键词:民猪;猪繁殖与呼吸综合征;恢复力;代谢组学
-
胚胎干细胞技术在北京黑猪的种质资源保护中的应用前景
作者:杨靖辉;倪雪静;胡鑫;路宇昊;路永强;曹素英
关键词:北京黑猪;胚胎干细胞;种质资源;动物育种
-
31份藜麦种质农艺性状及ISSR遗传多样性分析
作者:姚佳;杨发荣;刘文瑜;黄杰;魏玉明;杨超;刘欢
关键词:藜麦;农艺性状;遗传多样性;ISSR分子标记;聚类分析
-
番茄苗期根际加温对其生长及水分吸收的影响
作者:孙茜;徐凡;王湛;郭文忠;王朝军;李灵芝
关键词:番茄;根际加温;生长;光合;地上部干重
-
ENSO事件下西北太平洋远东拟沙丁鱼和日本鲭栖息地协同变化特征
作者:刘思源;张衡;杨超;方舟
关键词:远东拟沙丁鱼;日本鲭;西北太平洋;厄尔尼诺;拉尼娜;栖息地