云南省番茄莴苣褪绿病毒分子检测及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冯丽肖

作者： 冯丽肖;胡荣;卜姗;张德咏;罗香文;李凡;丁铭;张卓;张松柏;刘勇

作者机构：

关键词： 番茄;莴苣褪绿病毒;分子检测;系统发育分析;进化

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2022 年 49 卷 001 期

页码： 141-147

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采集了77份云南省疑似感染莴苣褪绿病毒(lettuce chlorosis virus,LCV)的番茄样本,采用特异性反转录PCR扩增LCV次要外壳蛋白基因(minor coat protein,CPm)近全长序列,常规Sanger测序法测定相应片段序列,并对其进行遗传进化分析.结果 表明,LCV特异性反转录PCR扩增得到与预期大小(1.38 kb)一致的特异性条带;采集的77份番茄样本中LCV检出率为12.99%.测定的LCV CPm;发育分析表明,所有LCV分离物可分为3个亚簇,具有明显的地域特性,其中LCV云南分离物与中国其他地区LCV分离物聚为一亚簇,来自美洲和欧洲分离物分别聚为一个簇.遗传进化分析表明,LCV云南分离物YN58有1个重组事件,序列中嘧啶(C/T)替换率最高(25.25),呈现独立进化、加速扩展趋势.这是在云南省首次报道发现LCV.

分类号： S641.2

  • 相关文献
作者其他论文 更多>>

微信小程序