花生TCP转录因子的全基因组鉴定及组织表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王通

作者： 王通;赵孝东;甄萍萍;陈静;陈明娜;陈娜;潘丽娟;王冕;许静;禹山林;迟晓元;张建成

作者机构： 山东省花生研究所/农业农村部花生生物学与遗传育种重点实验室;山东省临沂市农业科学院;德州市临邑县农业农村局

关键词： 花生;TCP转录因子;全基因鉴定;基因表达

期刊名称： 作物杂志

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 35-44

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TCP基因家族是植物中一类重要的转录因子,参与植物整个生长发育阶段的调控,尤其在花器官和分生组织中发挥重要作用。目前,在花生中尚无TCP相关基因的报道。为研究花生各TCP转录因子的生物调控作用,以及为进一步分析花生TCP基因提供参考信息,利用生物信息学方法在全基因组水平对花生TCP家族基因进行鉴定,分析其染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序和基因表达模式。结果分别从花生野生种和栽培种鉴定出19个和32个TCP基因,不均匀分布在9个野生种染色体和14个栽培种染色体上。系统进化分析表明,51个花生TCP基因可划分为亚家族Ⅰ（PCF）和亚家族Ⅱ两个亚类,其中亚家族Ⅱ包括2个分支,CIN和CYC/TB1。这些基因都含有高度保守的bHLH结构域,但其内含子结构存在较大差异,内含子数量及长度分布与基因的系统进化有较大关系,其中亚家族Ⅰ成员的内含子较少,亚家族Ⅱ内含子较多,且长度差异较大。表达谱分析显示,仅有7个基因在各组织中呈现显著差异性表达,其中有6个基因的差异表达与分生组织和花器官有关,推测其在花生茎尖和花的生长发育过程中起重要作用。

分类号： S565.2

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