高致病性PRRSVTJ株Nsp2蛋白的缺失及其二级结构预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王凤雪

作者： 王凤雪;冷雪;李真光;温永俊;刘准;武华

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;非结构蛋白2;蛋白缺失;蛋白二级结构

期刊名称： 湖南农业大学学报

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2011 年 37 卷 4 期

页码： 429-435

收录情况： CSCD

摘要： 根据GenBank上发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)TJ株F_3代全基因序列(GenBank登录号为 EU860248),结合多个PRRSV亚洲株Nsp2基因比对结果,设计合成引物,选择高致病性PRRSVTJ株噬斑克隆纯化前后14个不同代次,利用合成的引物扩增各代次Nsp2基因的高变区片段及F_3代和F_92代Nsp2全基因,并进行产物克隆和氨基酸序列分析及结构预测。测序结果表明:PRRSVTJ株在克隆传代过程中出现了序列整段缺失,共缺失120个氨基酸,并且从F_18代噬斑克隆开始一直稳定存在。缺失高变区及Nsp2蛋白二级结构预测结果表明:缺失的氨基酸使Nsp2蛋白在空间结构上发生了较大的变化,推测这可能与PRRSVTJM-F92的毒力和致病力减弱有关。

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