北极狐及乌苏里貉抑制素α亚基基因克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张宇飞

作者: 张宇飞;李晓霞;王士勇;曹新燕;刁云飞;杨镒峰;陈秀敏;赵伟刚;赵蒙;魏海军;许保增

作者机构:

关键词: 北极狐;乌苏里貉;抑制素α(INHα)亚基基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2017 年 12 期

页码: 3391-3400

收录情况: 北大核心

摘要: 试验旨在克隆北极狐及乌苏里貉抑制素α(inhibinα,INHα)亚基基因并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中犬科INHα预测mRNA序列(登录号:XM_545660.5)设计1对引物,用RT-PCR技术从北极狐及乌苏里貉的卵巢组织中扩增出INHα亚基基因,同时将其插入到克隆载体中,进行测序及生物信息学分析。测序结果表明,北极狐及乌苏里貉的INHα亚基基因CDS序列全长为1 107bp,编码369个氨基酸。北极狐及乌苏里貉的INHα亚基基因与犬的同源性最高,分别为97.9%与97.6%。系统进化树分析表明,北极狐及乌苏里貉与犬亲缘关系较近,同时也说明INHα亚基基因在不同物种及进化过程中具有高度保守性。对INHα亚基蛋白的高级结构预测发现,由于半胱氨酸间形成的二硫键导致其采用"蝴蝶形"或"开放手"构型,其中α-螺旋形成分子的"手腕"结构,β-折叠形成分子的"手指"结构。本研究成功克隆了北极狐及乌苏里貉的INHα亚基基因,同时进行了系统的生物信息学分析,为今后研究抑制素在卵母细胞-颗粒细胞同步发育过程中的生物学功能奠定了基础。

分类号: S865.2

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