猪乙型脑炎病毒SH0601株基因组序列测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑浩

作者： 郑浩;余丹丹;孙志;高飞;袁世山

作者机构：

关键词： 序列测定;基因组分;SH0601;乙型脑炎病毒;进化分析;序列分析结果;分离株;基因序列;pBluescript;病毒基因组

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年卷期： 2007 年

页码： 5

收录情况： CSCD

摘要： 将猪源JEVSH0601株基因组RNA分五段进行RT-PCR并克隆入pCRⅡ-Blunt-TOPO和pBluescript载体中,测定了全长cDNA序列,并根据E蛋白基因序列对SH0601株进行了遗传分型。cDNA序列分析结果表明:SH0601株基因组全长10977nt,与GenBank中的Beijing-1、P3、SA14和SA14-14-2株基因组全长相比,在3′NTR的10701nt处多一碱基"G",与上述四株病毒的全长核苷酸的同源率都达97.2%以上,而与国外猪源分离株KV1899和JEV/sw/Mie/41/2002全长核苷酸的同源率仅达88.7%,但SH0601株与六株病毒的全长...

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