2011—2016年浙江省猪流行性腹泻病毒S基因与ORF3基因遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴旺霞

作者： 吴旺霞;王一成;吴润;袁秀芳;徐丽华

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻病毒;S基因;ORF3基因;序列特点;基因进化分析

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2017 年 29 卷 03 期

页码： 380-388

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为调查近年来浙江省猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗株的S基因和ORF3基因遗传变异情况,2011—2016年,从浙江省各地区采集疑似猪流行性腹泻病料并提取其RNA,用3对特异性引物对S基因和ORF3基因进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析。结果表明:与国内疫苗株CV777相比,12个样品株的S基因存在15个核苷酸插入和6个核苷酸缺失,导致氨基酸序列存在5个氨基酸插入(~(58)QGVN~(61)和~(140)N)和2个氨基酸缺失(~(163)DI~(164)),且在主要突变区S1区的2个中和表位(499-638和764-771 aa)有8处氨基酸突变;样品株的ORF3基因有7处氨基酸变异。遗传进化分析结果显示,12株分离株的S基因与亚洲主要疫苗株(国内疫苗株CV777和韩国弱毒疫苗株DR13)的同源性仅为93.3%~94.9%,而与2011—2016年中国流行株(BJ-2011和Hu N)的同源性高达97.8%~99.9%,表明近年来猪流行性腹泻病毒呈现较大程度的变异,可为研制更加有效的疫苗奠定基础。

分类号： S852.65

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