病原菌诱导转录的水稻Rim2家族转座酶编码亚组的结构与分布

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田平芳

作者： 田平芳;王国栋;吴刚;李群;罗利军;李德葆;何祖华

作者机构：

关键词： 水稻;Rim2因子;转座酶编码亚组;分子结构;分布

期刊名称： 植物生理与分子生物学学报

ISSN： 0257-4829

年卷期： 2003 年 29 卷 03 期

页码： 257-264

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以基因组克隆Rim2 5 6 9为代表 ,分析了该家族中转座酶编码亚组的分子结构 ,同时对Rim2因子在染色体和不同水稻品种之间的差别分布情况进行了研究。序列分析表明 ,Rim2 5 6 9具有完整的 16 bp的末端颠倒重复序列 (TIRs)、若干正向和反向的 16 bp的亚末端重复 (STRs)以及插入位点 3 bp的同向重复。它的TIRs上具有保守序列CACTG ,有别于以往报告的CACTA转座子。该因子含有一个编码区 ,与已报告的Rim2cDNA的ORF基本一致 ,其预测编码蛋白与CAC TA转座子编码的转座酶TNP2和TNPD有低度的同源性。该亚组的其它因子的分子结构均与Rim2 5 6 9的相似 ,但这些因子预测ORF长度上存在着差异 ,反映了结构上的多样性。对检索到的Rim2因子的定位作图表明 ,它们在已测序拼接完成的第 1、4和 10号染色体上呈不均匀分布 ,以着丝点附近的分布频率为最高。PCR反应显示 ,Rim2编码因子在品种之间存在着编码序列多态性。

分类号： S511

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