尼罗罗非鱼MYF5基因SNP位点筛选及其与不同群体生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 佟延南

作者： 佟延南;高风英;刘志刚;王淼;曹建萌;衣萌萌;可小丽;卢迈新;朱海

作者机构：

关键词： 尼罗罗非鱼;肌源性调节因子5;单核苷酸多态性;双倍型;生长性状

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 935-946

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探寻肌源性调节因子5基因（MYF5）的单核苷酸多态性（SNP）标记与尼罗罗非鱼（Oerochromis niloticus）生长性状的相关性，采用PCR和测序法筛查SNP,并通过测序方法确认，从筛查到的35个SNP位点中挑选多态性较好的30个位点在尼罗罗非鱼高要亲代群体中进行分型分析，并与生长性状进行关联分析，将获得的生长相关位点在高要子代群体、番禺群体及海南群体中进行验证。结果表明：高要亲代群体中S18（G-1739C）位点与体质量、体宽显著相关（P＜0.05）,S3（A-113G）和S4（C-170T）位点与全长显著相关（P＜0.05）,S5（C-323T）和S24（C-2345T）位点与头长显著相关（P＜0.05）;高要子代群体中，S3、S4位点与体质量显著相关（P＜0.05）,S24位点与体长、体高显著相关（P＜0.05）;在番禺群体中获得的与体质量显著相关的SNP位点分别为S7（A-626T）、S21（C-2090G）和S32（G-2759T）,与全长显著相关的SNP位点为S7;海南群体中未获得与生长性状显著相关的SNP位点；双倍型与各群体生长性状关联分析表明，在高要亲代群体中获得与全长、头长、体高显著相关的双倍型各1个，在高要子代群体中获得与体质量显著相关的双倍型1个，在番禺群体及海南群体中未获得与生长性状相关的双倍型。研究表明，从高要群体MYF5基因上获得的S3、S4和S18 3个SNP位点可能影响尼罗罗非鱼的生长性状或与之紧密连锁，这些位点可以作为候选基因标记，用于尼罗罗非鱼生长相关分子标记辅助育种研究。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]尼罗罗非鱼MYF6基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析. 高风英,佟延南,刘志刚,曹建萌,王淼,衣萌萌,可小丽,卢迈新,朱海. 2024

[2]POU1F1基因SNP位点与尼罗罗非鱼体质量和形态性状的相关性. 高风英,佟延南,曹建萌,刘志刚,王淼,衣萌萌,可小丽,卢迈新,朱海. 2024

[3]草鱼载脂蛋白A-Ⅰ-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析. 刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰. 2012

[4]草鱼载脂蛋白A-I-1基因3'非编码区SNPs筛选及其与生长性状的关联分析. 刘小献,白俊杰,于凌云,李胜杰. 2012

[5]吉富尼罗罗非鱼Ikaros基因5′调控区的克隆、序列分析及抗无乳链球菌相关SNP位点筛选. 陈昆平,卢迈新,刘志刚,高风英,曹建萌,张德锋,李庆勇,胡欣欣. 2018

[6]尼罗罗非鱼微卫星标记与主要生长性状的相关性分析. 刘福平,白俊杰,宋红梅,叶星,李胜杰,于凌云. 2010

[7]尼罗罗非鱼生长激素促分泌素受体基因(GHSR)生长相关单核苷酸多态性(SNPs)位点的筛选. 王春晓,卢迈新,高风英,刘志刚,曹建萌,朱华平,可小丽,王淼,叶星. 2015

[8]尼罗罗非鱼ghrelin基因的多态性及其与生长性状相关SNP位点的筛选. 王春晓,卢迈新,高风英,刘志刚,曹建萌,朱华平,可小丽,王淼,叶星. 2016

[9]尼罗罗非鱼生长性状相关微卫星标记的筛选与验证. 刘志刚,高风英,佟延南,衣萌萌,王淼,朱海,卢迈新,可小丽,曹建萌. 2023

[10]MRFs家族基因多态性与尼罗罗非鱼成鱼生长性状的关联性分析. 张士彪,陈炳霖,邹芝英,肖炜,祝璟琳,喻杰,李大宇,杨弘. 2025

[11]IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析. 宋姗姗,刘宗岳,丛波,刘琳玲,宋兴超,彭英华. 2019

[12]无角牦牛Hesx1基因多态性及其与生长性状的关联分析. 张浩,王宏博,马武,贾聪俊,马晓明,吴晓云,褚敏,阎萍,成述儒,梁春年. 2019

[13]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[14]大口黑鲈NPY基因多态性及与生长的关联分析. 李胜杰,刘浩,白俊杰,吴建开,马冬梅,费志平,樊佳佳,孙建国. 2018

[15]猪PIT-1基因多态性与生长性状的关联分析. 许金根,曹祖兵,王立克,顾有方,李升和,李庆岗. 2017

[16]大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析. 李胜杰,樊佳佳,姜鹏,白俊杰,孙建国,吴建开,费志平. 2018

[17]沃金黑牛GPR41基因多态性及其与不同阶段生长性状的相关性分析. 刘宇,肖成,金海国,杨少滢,缪立生,沈宏旭,曹阳. 2022

[18]草鱼柠檬酸合酶基因SNP筛选及与生长性状的关联分析. 樊佳佳,刘小献,白俊杰,于凌云. 2014

[19]大口黑鲈组织蛋白酶B基因SNP筛选及其与生长性状关联分析. 李胜杰,周春龙,白俊杰,吴建开,樊佳佳,费志平,孙建国,马冬梅. 2018

[20]牙鲆mstn基因SNPs位点多态性与生长性状的关联分析. 李兵部,王桂兴,张晓彦,刘玉峰,何忠伟,曹巍,任建功,任玉芹,张祎桐,伞利择,王玉芬,侯吉伦. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序