白菜型油菜CCT基因的全基因组鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李华欣

作者： 李华欣;王龙;马茜茹;裴大妹;肖麓

作者机构：

关键词： 白菜型油菜;CCT基因;开花时间;进化分析;生物信息学;转录组

期刊名称：

ISSN： 1001-0629

年卷期： 2024 年 41 卷 11 期

页码： 2637-2650

摘要： CCT基因是指编码蛋白包含CCT (CONSTANS, CONSTANS-LIKE 和 TOC1)结构域的基因的统称，广泛存在于高等植物中，并且是与植物开花性状相关的重要基因家族之一，这些基因不仅参与了植物对光周期的响应过程，还在非生物胁迫应答以及植物激素信号转导等环节中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学和比较基因组学的方法，最终在白菜型油菜(Brassica chinensisvar.oleifera Makino et Nemoto)中鉴定到69个CCT家族基因，并对其理化性质、系统进化关系、保守结构域、基因结构、共线性关系、顺式作用元件、KEGG富集和不同组织/器官中的表达模式等进行了分析。结果表明，69个BrCCTs基因不均匀地分布在10条染色体上，根据保守结构域的不同，可以分为4个亚族，同一亚族成员的保守基序高度相似，然而基因结构差异较大，并且多数成员均含有光响应元件和激素响应元件，表明其可能在调节植物开花以及生长发育过程中发挥重要作用。KEGG富集分析发现CCT家族基因主要富集在细胞功能和核酸结合位点通路上。转录组结果表明，69个BrCCTs在根、茎、叶、花和愈伤组织中有着不同的表达模式，尤其COL亚族的成员表达水平较为显著。本研究为进一步了解白菜型油菜CCT基因家族的功能和作用提供了参考，为油菜早熟品种的选育和改良奠定了基础。

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[1]白菜型油菜CCT基因的全基因组鉴定及表达模式分析. 李华欣,王龙,马茜茹,裴大妹,肖麓. 2024

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