南方根结线虫诱导辣椒基因CaRKNIF2的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑井元

作者： 郑井元;邹学校;茆振川;陈国华;谢丙炎

作者机构：

关键词： WRKY转录因子;CaRKNIF2;cDNA;Southern杂交;基因表达

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2010 年 43 卷 24 期

页码： 5046-5054

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】明确辣椒(Capsicum annuum L.HDA149)中与南方根结线虫(Meloidogyne incognita)不亲和互作过程中抗性相关WRKY转录因子的基因结构及其表达模式。【方法】采用RACE结合RT-PCR方法克隆cDNA序列,并根据cDNA序列设计特异引物扩增DNA序列,Southern杂交确定基因拷贝数,实时荧光定量PCR方法分析该基因在线虫侵染后辣椒的不同组织和不同时间点的表达。【结果】从辣椒中克隆到一个WRKY转录因子基因CaRKNIF2(GenBank登录号:GQ253367),该基因编码区全长1662bp,编码553个推定的氨基酸,为单拷贝基因。CaRKNIF2基因编码区全长DNA序列2530bp,包含5个内含子和6个外显子。在线虫接种诱导处理时,该基因表达具有组织特异性,根尖组织中的表达量最高;接种3h后在根尖组织中的表达量开始升高,12h最高,此时相对表达量约为3.1倍。【结论】CaRKNIF2在线虫接种处理后的表达上调,表明该基因参与了抗性基因Me3介导的辣椒与根结线虫的不亲和互作,可能在此过程中具有重要功能。

分类号： S436.418

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