柑桔BES-SSR标记开发及连锁图延伸和加密

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马喜军

作者： 马喜军;龚桂芝;彭祝春;韩学智;洪棋斌

作者机构：

关键词： 柑桔;遗传图谱;分子标记;SSR

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2012 年 32 卷 06 期

页码： 1112-1117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了系统性地开发和拓展柑桔SSR标记,通过对公布的柑桔BAC文库末端序列(BAC-End sequence,BES)进行SSR分析,选择1500个SSR位点设计合成并检测323对引物。结果表明:(1)从总长度为28.1 Mb的46 339条序列中共检测出22 403个SSR位点,约每2条序列就会出现一个SSR位点,发生频率为48%,相当于平均1.25kb的序列中就会出现1个SSR,频率约为柑桔EST的2倍,且不同核心重复序列的SSR发生特点与EST也不同。(2)所合成的323对引物中,有效扩增316对,扩增率约98%,173对表现多态性,总多态性比率约55%,多态性引物中单核苷酸重复类型15对,双核苷酸重复类型100对,三核苷酸及以上重复类型58对,表明柑桔BES中具有较为丰富的多态性SSR标记。(3)结合已发表的遗传作图数据,对总计349个多态性位点进行遗传连锁分析,获得的新遗传连锁图谱共含有9个连锁群、334个SSR标记、总长844.2cM、平均图距2.53cM,延长和加密了先前的图谱。该研究开发的新SSR标记为开展柑桔遗传鉴定分析和遗传图谱构建提供了新的标记来源,加密的遗传图谱为柑桔的基因定位、图位克隆和标记辅助育种等奠定了基础,SSR分析结果也为其他物种SSR标记的开发提供了参考。

分类号： S666

  • 相关文献

[1]应用RAPD标记构建柑桔分子遗传图谱. 胡会刚,叶自行,胡桂兵,董晨. 2013

[2]柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进(英文). 向旭,邓占鳌,郑启发,陈存贤,Frederick G.Gmitter Jr. 2009

[3]冀豆12遗传图谱初步构建. 张玥颖,刘兵强,刘立伟,闫龙. 2009

[4]黄瓜作图亲本间分子标记的多态性分析. 黄焕焕,张桂华,韩毅科,魏爱民,杜胜利,张显. 2007

[5]黄瓜远缘群体分子遗传连锁图谱的构建和分析. 徐晴,张桂华,韩毅科,魏爱民,杜胜利,张显. 2008

[6]控制甜瓜雄花分化基因的遗传分析及初步定位. 路绪强,马鸿艳,刘宏宇,栾非时. 2010

[7]基于RIL群体鉴定棉花抗黄萎病相关QTLs. 鲁宁宁,王红梅. 2019

[8]花生SSR分子标记的开发与利用. 王金彦,杨庆利,禹山林. 2009

[9]玉米丝裂病的抗性QTL定位. 魏昕,李丽华,王振华,宋锐,曾兴,张志明,荣廷昭,潘光堂. 2009

[10]花生栽培种SSR遗传图谱的构建. 洪彦彬,梁炫强,陈小平,刘海燕,周桂元,李少雄,温世杰. 2009

[11]利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱. 赵湘,于拴仓,薛林宝,张凤兰,赵凡,余阳俊,赵岫云,张德双,汪维红. 2011

[12]SSR作为锚定标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱. 赵凡,于拴仓,石岭,张凤兰,余阳俊,赵岫云,张德双. 2010

[13]印度南瓜遗传图谱的构建. 向成钢,王长林,王学香,刘芳芳,陈花,王迎杰. 2013

[14]玉米分子遗传框架图谱构建. 荣廷昭,黄烈健,唐海涛 ,向道权,戴景瑞. 2004

[15]四倍体马铃薯SSR遗传图谱的构建及晚疫病抗性QTL初步定位. 刘龙超,周云,贺苗苗,张艳萍,叶广继. 2016

[16]玉米种子休眠性的QTL定位. 兰海,李新海,王凤格,高世斌,曹墨菊,唐祈林,潘光堂,赵久然,荣廷昭. 2007

[17]大白菜SSR锚定标记分子遗传图谱的构建. 于仁波,于拴仓,戚佳妮,张凤兰,余阳俊,赵岫云,张德双. 2008

[18]枇杷遗传连锁图谱的初步构建与分析. 谢丽雪,蒋际谋,张立杰,郑姗,张小艳,李韬. 2014

[19]棉花种间SSR标记遗传图谱的构建. 王玉晶,杨洋,胡文冉,曹佳强,张桦,范玲. 2014

[20]甜菜遗传连锁图谱初步构建. 王茂芊,李博,王华忠. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序