基于宏基因组学的成年和老年袋鼠肠道菌群多样性和差异性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高云航

作者： 高云航;徐佳萍;赵晗旭;邸海洋;王巍;娄玉杰;马红霞

作者机构：

关键词： 袋鼠;肠道菌群;宏基因组学

期刊名称： 中国兽医杂志

ISSN： 0529-6005

年卷期： 2016 年 52 卷 01 期

页码： 103-105+51

收录情况： 北大核心

摘要： 为了了解袋鼠粪便中菌群的多样性,分析成年和老年袋鼠粪便中菌群的差异性。应用高通量测序技术测定成年和老年袋鼠粪便细菌16S rDNA的V3-V4变异区序列,应用Prinseq和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析菌群物种丰度、分布和Alpha多样性。获得成年袋鼠粪便(AK)的OTU数为7 210,老年袋鼠粪便(OK)的OTU数为6 120。AK和OK的丰富度指数分别为4 377.028/7301.574和1 430.718/1858.623,香农指数分别为6.275和4.273。AK和OK肠道优势菌群均隶属厚壁菌门,分别占65%(AK)和78%(OK),除此之外,共有优势菌门还有变形菌门、拟杆菌门和螺旋菌门,但AK有四种独有菌门。获得了成年和老年袋鼠粪便中细菌的丰富度、菌群结构及差异性。

分类号： S852.6`S865.1

  • 相关文献

[1]唾液乳杆菌SNK-6对新杨黑羽蛋鸡鸡蛋暗斑和肠道菌群的影响. 和笑笑,车培新,卫利春,卢奎,严华祥. 2020

[2]肉鸽肠道微生物菌群差异分析和抗生素耐药基因预测. 陶洁,李本强,程靖华,石迎,刘佩红,刘惠莉. 2023

[3]基于宏组学方法认识微生物群落及其功能. 马海霞,张丽丽,孙晓萌,张怀强,何明雄,陈冠军,王禄山. 2015

[4]宏基因组学方法分析奶牛瘤胃尿素分解菌的多样性. 赵圣国,王加启,刘开朗,李旦,于萍. 2010

[5]古菌、生命树和真核细胞的功能演化. 肖静,范陆,吴顶峰,徐雁冰,赖登训,William F.MARTIN,朱瑞新,张传伦. 2019

[6]好氧堆肥微生物代谢多样性及其细菌群落结构. 王秀红,李欣欣,史向远,王保平,周静,籍增顺. 2018

[7]宏基因组学揭示鳗鲡养殖环境微生物抗性基因的赋存特征. 黄薇,廖茜,罗土炎,宋永康. 2020

[8]鳗鲡肠道微生物抗性基因组成特征的初步分析. 黄薇,刘兰英,罗土炎,刘洋,宋永康. 2020

[9]基于宏基因组学分析广西地区生水牛乳中嗜冷菌多样性. 赵利旦,黄丽,韦盘秋,黄加祥,曾庆坤,李玲. 2023

[10]半纤维素分解菌群HMC的微生物群落结构及功能. 高秀清,王琼,罗轶伦,吕育财,崔明宇,陈永伦,张冬冬,肖园,范淄亭,王浩伟,王轶,郭鹏. 2024

[11]宏基因组技术在开发未培养微生物资源中的应用. 李丽娟,张殿昌,龚世园. 2007

[12]凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)循环水养殖系统中养殖效果及菌群结构和功能研究. 唐亚鹏,董世瑞,田吉腾,周茜,王印庚,张天时. 2022

[13]基于肠道宏基因组对弹涂鱼两栖适应性的研究. 董博,邓涵逸,孙艺秋,房元杰,彭淼曦,石琼,贝锦龙,魏文康,陈庄. 2022

[14]养猪发酵床微生物宏基因组基本分析方法. 刘波,王阶平,陈倩倩,刘国红,车建美,陈德局,郑雪芳,葛慈斌. 2016

[15]宏基因组学在牛生产中的应用研究进展. 苗艳,朱庆贺,陈亮,兰世捷,于辰龙,张蕾,李丹,张红,钟鹏,张备,田秋丰,黄宝银. 2023

[16]宏基因组学技术在动物传染病原挖掘中的应用与进展. 敬晓棋,李娟,郝婷婷,翟军军,郭慧琛. 2021

[17]宏基因组学:热带冬季瓜菜病害生物防治新策略. 赵志祥,陈圆,肖敏,陈绵才. 2015

[18]动物体内微生物的宏基因组学分析. 李珊珊,王加启,魏宏阳,杨永新,刘开朗,赵圣国,卜登攀. 2009

[19]基于宏基因组学的中华绒螯蟹养殖池塘水体微生物群落结构和功能组成分析. 张旭,周丽,蔡敏,崔娜欣,庞思,邹国燕,赵志勇,袁泉,黄伟伟,张亚雷. 2024

[20]宏基因组学在动物胃肠道微生物研究中的应用. 范忠原,李光玉,刘晗璐. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序