山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李昆谕

作者： 李昆谕;刘玉芳;陶林;江炎庭;欧阳依娜;储明星;洪琼花

作者机构： 云南省畜牧兽医科学院;河北工程大学生命科学与食品工程学院;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室

关键词： 山羊;繁殖性状;SNPs;EGR4;KDM4C;KDM6A

期刊名称： 特产研究

ISSN： 1001-4721

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 6-13

摘要： 本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性（SNPs）与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型，检测其在云上黑山羊（n=544）、济宁青山羊（n=133）和辽宁绒山羊（n=91）3个群体中的遗传学特征，并将其多态性与繁殖性状表型（产羔数、初生窝重、断奶窝重）进行关联分析。群体遗传学结果表明，EGR4 g.11029053G＞ T和g.11029600T＞ A位点在云上黑山羊中为中度多态（0.25 ＜PIC ＜0.5），在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态（PIC ＜0.25）,EGR4 g.11028295G＞ A位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC ＜0.25）;KDM4C g.37764228T＞ A位点在济宁青山羊中为中度多态（0.25 ＜PIC ＜0.5）,KDM4C g.37767773T＞ A和g.37768026C＞ G位点在3种山羊群体中为低度多态（PIC ＜0.25）;KDM6A g.27177505C＞ A在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态（0.25 ＜PIC ＜0.5），在云上黑山羊中为低度多态（PIC ＜0.25）。卡方适应性检验结果表明，EGR4 g.11028295G＞ A、g.11029053G＞ T和g.11029600T＞ A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞ 0.05）;KDM4C g.37764228T＞ A、g.37767773T＞ A和g.37768026C＞ G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞ 0.05）;KDM6A g.27102554T＞ A和g.27177505C＞ A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P ＜0.05），在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞ 0.05）。关联分析结果表明，在云上黑山羊中EGR4 g. 11029600T＞ A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P ＜0.05）;KDM4C g.37764228T＞ A位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P ＜0.05）;KDM6A g.27177505C＞A位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型（P ＜0.05）,g.27102554T＞ A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型（P ＜0.05）。综上所述，EGR4 g.11029600T＞ A、KDM4C g.37764228T＞ A和KDM6A g.27102554T＞ A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记；KDM4Cg.37764228T＞ A和KDM6Ag.27177505C＞ A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

分类号： S827

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