松材线虫伴生细菌多样性的宏基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田雪亮

作者： 田雪亮;张祺玲;陈国华;茆振川;杨家荣;谢丙炎

作者机构：

关键词： 松材线虫;伴生细菌;l6S rRNA基因文库;454测序;宏基因组

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2010 年 50 卷 7 期

页码： 909-916

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】松材线虫是松材线虫病的病原，且与其伴生细菌之间存在互作关系，它们构成一个微生态系统。本研究旨在揭示松材线虫．伴生细菌群落细菌多样性。【方法】采用l6S rRNA基因文库和454测序对伴生细菌群落的宏基因组进行初步分析。【结果】依据97％序列相似性划分0TU(Operational Taxonomic Unit)，构建的l6S rRNA文库包含25个OTU，分别属于Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria、 Gammaproteobacteria和Bacteroidetes，其中优势菌群为Gammaproteobacteria，特别是Stenotrophomonas maltophilia为优势细菌。在伴生细菌优势种群上，454测序结果与16S rRNA基因文库结果基本一致。【结论】松材线虫的伴生细菌多样性较高，这些细菌可能对松材线虫具有一定的生态意义。

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