两种穗伸出差异显著的大麦最上节间全长转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蒲茜

作者： 蒲茜;邱雪冰;张镌钰;汤燕燕;王金慧;李涛;杨钊;张海莉;梁俊俊;唐亚伟;邓光兵;龙海

作者机构：

关键词： 大麦;最上节间;全长转录组;可变剪接;长链非编码RNA

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2021 年 39 卷 004 期

页码： 459-466

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]对两份穗伸出差异显著的大麦(Hordeum vulgare L.)材料的最上节间(UI)进行全长转录组分析,为揭示大麦UI伸长调控机制奠定基础.[方法]以包穗大麦材料CDB0012和穗伸出正常大麦品种XL19为材料,利用Nanopore平台开展了UI全长转录组测序和生物信息分析.[结果]共获得46246条非冗余全长转录本,鉴定了2395个潜在新基因位点和44805条新转录本,开展了功能注释、可变剪切、差异表达基因鉴定等分析.[结论]构建了一套高质量大麦UI全长转录组数据集.

分类号： S512.3

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