果生炭疽菌Rab蛋白家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张丽勍

作者： 张丽勍;安海山;方献平;李水根;张学英

作者机构：

关键词： 果生炭疽菌;Rab蛋白;生物信息学;进化分析

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2022 年 38 卷 005 期

页码： 37-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用已报道的酿酒酵母的11个Rab蛋白氨基酸序列及Rab数据库对果生炭疽菌全基因组数据进行比对分析,共获得果生炭疽菌Rab蛋白10个.生物信息学分析表明:这10个Rab蛋白均不含信号肽和跨膜结构域,均为亲水蛋白.CfRab1和CfRab7蛋白定位于质膜,CfRab4蛋白定位于线粒体,其余7个Rab蛋白定位于高尔基体.该Rab蛋白家族均具有保守结构域,在丝状真菌中高度保守.实时荧光定量PCR结果表明,相对于菌丝阶段,CfRab5A和CfRabX1在孢子发育阶段表达量最高,CfRab1、CfRab2、CfRab4、CfRab5B、CfRab6、CfRab7和CfRab8在果生炭疽菌侵染后48 h表达量最高.研究为探究草莓果生炭疽菌Rab家族成员的功能奠定了基础.

分类号： S436.68

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