红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 彭佳佳

作者: 彭佳佳;刘克林;刘丽娅;吕学华;杨哲;李佩愉;刘春;明军;袁素霞;平吉成;张黎

作者机构:

关键词: 数字基因表达谱;红掌佛焰苞;花青素;基因表达水平;基因序列;关键基因;花色变化;关键酶

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2016 年 44 卷 03 期

页码: 48-52

收录情况: 北大核心

摘要: 以红掌佛焰苞S5(盛花期:红色)、S8(衰老期:绿色)时期为试验材料进行数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)测序,分别得到12 766 374条(1.28 G)、18 583 390条(1.86 G)可分析序列(clean reads),被成功注释有差异表达的基因序列2 316条。为探究红掌佛焰苞颜色变化过程中关键基因的表达水平,将差异基因定位在花青素生物合成途径11条表达量变化的序列上,并通过实时荧光定量PCR对其中的4条序列进行检验,验证了DGE测序结果的准确性。同时研究这4个序列在红掌佛焰苞生长过程中的表达水平,结果表明:在佛焰苞发育初期,3条序列相对表达量逐渐增高,1条在S2时期降低,但均在S3时期达到最高或较高值;在S4、S5、S6、S7、S8时期,随着佛焰苞的成熟,4条序列表达量大体上均逐渐下降,在S8衰老期表达量最低。研究结果证明了这4条基因序列是红掌佛焰苞花色形成中的关键基因,S3时期是花青素生物合成的高峰期。

分类号: S682.14

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