基于matK基因和ITS序列探讨大叶藻科的系统发育关系

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李渊

作者： 李渊;李文涛;孙典荣;高天翔

作者机构：

关键词： ITS;matK;大叶藻科;系统发育关系

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2011 年 35 卷 06 期

页码： 900-907

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 比较分析了15种大叶藻的matK基因和ITS片段的核苷酸序列,结果发现胞嘧啶(C)在两个目的片段上含量均较低。ITS基因片段检测到228处核苷酸替换,表现出丰富的遗传多态性;matK基因片段上有249处核苷酸替换,且大部分替换来自于第三密码子的同义替换,种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。基于matK基因和ITS片段,利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树结果基本一致,明显分为4大支,大叶藻亚属、异叶藻属、拟大叶藻亚属和虾形藻属分别构成一支。大叶藻亚属和拟大叶藻亚属的核苷酸差异值在29.09%—35.51%,超过了屈良鹄等提出的大部分被子植物ITS属间核苷酸差异值(9.60%—28.80%),在分子数据上两亚属都达到了属的水平。研究结果支持Tomlinson和Posluszny对大叶藻科的划分结果,建议将大叶藻科分为4个属。

分类号： Q945.4

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